MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL840

Total Repeats: 1585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011311	CAT	2	6	52429	52434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778398
1002	NC_011311	AAG	2	6	53261	53266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778399
1003	NC_011311	TTC	2	6	53277	53282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778399
1004	NC_011311	AGCG	2	8	53291	53298	25 %	0 %	50 %	25 %	215778399
1005	NC_011311	AT	3	6	53318	53323	50 %	50 %	0 %	0 %	215778399
1006	NC_011311	GCA	2	6	53363	53368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778399
1007	NC_011311	ATT	2	6	53425	53430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778399
1008	NC_011311	TAA	2	6	53492	53497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778399
1009	NC_011311	A	6	6	53505	53510	100 %	0 %	0 %	0 %	215778399
1010	NC_011311	GAAA	2	8	53514	53521	75 %	0 %	25 %	0 %	215778399
1011	NC_011311	A	9	9	53526	53534	100 %	0 %	0 %	0 %	215778399
1012	NC_011311	CCAACG	2	12	53580	53591	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	215778399
1013	NC_011311	ATG	2	6	53599	53604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778399
1014	NC_011311	TTG	2	6	53608	53613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778399
1015	NC_011311	ACA	2	6	53616	53621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778399
1016	NC_011311	TCA	2	6	53647	53652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778399
1017	NC_011311	AAAT	2	8	53684	53691	75 %	25 %	0 %	0 %	215778399
1018	NC_011311	ACTT	2	8	53734	53741	25 %	50 %	0 %	25 %	215778399
1019	NC_011311	TTAA	2	8	53781	53788	50 %	50 %	0 %	0 %	215778399
1020	NC_011311	ACTT	2	8	53896	53903	25 %	50 %	0 %	25 %	215778399
1021	NC_011311	AC	3	6	53934	53939	50 %	0 %	0 %	50 %	215778399
1022	NC_011311	T	6	6	53962	53967	0 %	100 %	0 %	0 %	215778399
1023	NC_011311	GA	3	6	53993	53998	50 %	0 %	50 %	0 %	215778399
1024	NC_011311	AT	3	6	54006	54011	50 %	50 %	0 %	0 %	215778399
1025	NC_011311	GCA	2	6	54042	54047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778399
1026	NC_011311	AGA	2	6	54711	54716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778400
1027	NC_011311	CTA	2	6	54824	54829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778400
1028	NC_011311	CAT	2	6	54906	54911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778400
1029	NC_011311	ACA	2	6	54997	55002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778400
1030	NC_011311	TAGTC	2	10	55017	55026	20 %	40 %	20 %	20 %	215778400
1031	NC_011311	GTTA	2	8	55033	55040	25 %	50 %	25 %	0 %	215778400
1032	NC_011311	GAC	2	6	55081	55086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778400
1033	NC_011311	AGG	2	6	55166	55171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215778400
1034	NC_011311	TGAT	2	8	55262	55269	25 %	50 %	25 %	0 %	215778400
1035	NC_011311	ATA	2	6	55310	55315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778400
1036	NC_011311	ACG	2	6	55331	55336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778400
1037	NC_011311	TAAAG	2	10	55419	55428	60 %	20 %	20 %	0 %	215778400
1038	NC_011311	A	6	6	55450	55455	100 %	0 %	0 %	0 %	215778400
1039	NC_011311	TTA	2	6	55598	55603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778400
1040	NC_011311	TAA	2	6	55722	55727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778400
1041	NC_011311	GAT	2	6	55846	55851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778400
1042	NC_011311	CAAC	2	8	55877	55884	50 %	0 %	0 %	50 %	215778400
1043	NC_011311	TCA	2	6	55916	55921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778400
1044	NC_011311	CGT	2	6	55929	55934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778400
1045	NC_011311	GC	3	6	55939	55944	0 %	0 %	50 %	50 %	215778400
1046	NC_011311	AT	5	10	56046	56055	50 %	50 %	0 %	0 %	215778401
1047	NC_011311	AC	3	6	56126	56131	50 %	0 %	0 %	50 %	215778401
1048	NC_011311	AAC	2	6	56171	56176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778401
1049	NC_011311	AAC	3	9	56212	56220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778401
1050	NC_011311	TGC	2	6	56230	56235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778401
1051	NC_011311	AT	3	6	56247	56252	50 %	50 %	0 %	0 %	215778401
1052	NC_011311	TAT	2	6	56275	56280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778401
1053	NC_011311	A	6	6	56315	56320	100 %	0 %	0 %	0 %	215778401
1054	NC_011311	TGG	2	6	56329	56334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215778401
1055	NC_011311	TTAT	2	8	56389	56396	25 %	75 %	0 %	0 %	215778401
1056	NC_011311	TGA	3	9	56431	56439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778401
1057	NC_011311	A	7	7	56446	56452	100 %	0 %	0 %	0 %	215778401
1058	NC_011311	TGA	2	6	56572	56577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778401
1059	NC_011311	A	6	6	56618	56623	100 %	0 %	0 %	0 %	215778401
1060	NC_011311	TTA	3	9	57055	57063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778402
1061	NC_011311	AAT	2	6	57086	57091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778402
1062	NC_011311	TC	3	6	57109	57114	0 %	50 %	0 %	50 %	215778402
1063	NC_011311	ACC	2	6	57232	57237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215778402
1064	NC_011311	GGC	2	6	57238	57243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215778402
1065	NC_011311	ATT	2	6	57286	57291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778402
1066	NC_011311	GCT	2	6	57309	57314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778402
1067	NC_011311	GTC	2	6	57330	57335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778402
1068	NC_011311	CTTC	2	8	57336	57343	0 %	50 %	0 %	50 %	215778402
1069	NC_011311	CTT	2	6	57456	57461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778402
1070	NC_011311	AAAAAT	2	12	57477	57488	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	215778402
1071	NC_011311	TC	3	6	57495	57500	0 %	50 %	0 %	50 %	215778402
1072	NC_011311	TTA	2	6	57506	57511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778402
1073	NC_011311	TCA	2	6	57560	57565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778402
1074	NC_011311	TGA	2	6	57588	57593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778402
1075	NC_011311	ACG	2	6	57604	57609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778402
1076	NC_011311	T	6	6	57614	57619	0 %	100 %	0 %	0 %	215778402
1077	NC_011311	TTTTTG	2	12	58392	58403	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	215778403
1078	NC_011311	GAA	2	6	58406	58411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778403
1079	NC_011311	TCG	2	6	58427	58432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778403
1080	NC_011311	TATGA	2	10	58447	58456	40 %	40 %	20 %	0 %	215778403
1081	NC_011311	GCT	2	6	58523	58528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778403
1082	NC_011311	ATT	2	6	58536	58541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778403
1083	NC_011311	TTATC	2	10	58556	58565	20 %	60 %	0 %	20 %	215778403
1084	NC_011311	T	6	6	58568	58573	0 %	100 %	0 %	0 %	215778403
1085	NC_011311	CTG	2	6	58574	58579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778403
1086	NC_011311	TTC	3	9	58635	58643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778403
1087	NC_011311	A	6	6	58646	58651	100 %	0 %	0 %	0 %	215778403
1088	NC_011311	TGT	2	6	58710	58715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778404
1089	NC_011311	T	7	7	58747	58753	0 %	100 %	0 %	0 %	215778404
1090	NC_011311	GTT	3	9	58807	58815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778404
1091	NC_011311	GTT	2	6	58822	58827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778404
1092	NC_011311	CAC	2	6	58846	58851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215778404
1093	NC_011311	TCT	2	6	58902	58907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778404
1094	NC_011311	TATT	2	8	59540	59547	25 %	75 %	0 %	0 %	215778405
1095	NC_011311	GAT	2	6	59588	59593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778405
1096	NC_011311	TA	3	6	59594	59599	50 %	50 %	0 %	0 %	215778405
1097	NC_011311	GCT	2	6	59624	59629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778405
1098	NC_011311	TAA	2	6	59662	59667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778405
1099	NC_011311	TAA	2	6	59677	59682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778405
1100	NC_011311	A	7	7	59681	59687	100 %	0 %	0 %	0 %	215778405
1101	NC_011311	ATT	2	6	59695	59700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778405
1102	NC_011311	ATT	2	6	59720	59725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778405
1103	NC_011311	TGTTCC	2	12	59740	59751	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	215778405
1104	NC_011311	ATA	2	6	59786	59791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778405
1105	NC_011311	AATTC	2	10	59804	59813	40 %	40 %	0 %	20 %	215778405
1106	NC_011311	CTA	2	6	59937	59942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778405
1107	NC_011311	GAT	2	6	59963	59968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778405
1108	NC_011311	TTA	2	6	60120	60125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778405
1109	NC_011311	AGTA	2	8	60130	60137	50 %	25 %	25 %	0 %	215778405
1110	NC_011311	ATA	2	6	60138	60143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778405
1111	NC_011311	TTG	2	6	60183	60188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778405
1112	NC_011311	AAT	2	6	60241	60246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778405
1113	NC_011311	TA	4	8	60309	60316	50 %	50 %	0 %	0 %	215778405
1114	NC_011311	GTAA	2	8	60341	60348	50 %	25 %	25 %	0 %	215778405
1115	NC_011311	TAA	2	6	60370	60375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778405
1116	NC_011311	A	6	6	60399	60404	100 %	0 %	0 %	0 %	215778405
1117	NC_011311	TGA	2	6	60415	60420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778405
1118	NC_011311	CAG	2	6	60443	60448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778405
1119	NC_011311	ATG	3	9	60456	60464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778405
1120	NC_011311	TGATC	2	10	60511	60520	20 %	40 %	20 %	20 %	215778405
1121	NC_011311	CAT	2	6	60539	60544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778405
1122	NC_011311	TAA	3	9	60547	60555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778405
1123	NC_011311	TGA	2	6	60586	60591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778405
1124	NC_011311	A	6	6	60613	60618	100 %	0 %	0 %	0 %	215778405
1125	NC_011311	A	6	6	60648	60653	100 %	0 %	0 %	0 %	215778405
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1127	NC_011311	ATT	2	6	60714	60719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778405
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